南京一本大學排名第一的是南京大學，排名第二的是東南大學，排名第三的是南京航空航天大學，以下是具體榜單，供大家參考。

南京大學

南京大學（Nanjing University），簡稱“南大”，位于江蘇省南京市，是中華人民共和國教育部直屬、中央直管副部級建制的全國重點大學，位列國家“雙一流”、“985工程”、“211工程” 重點建設(shè)高校，入選“珠峰計劃”、“強基計劃”、“111計劃”、“2011計劃”，為九校聯(lián)盟（C9）、中國大學校長聯(lián)誼會、環(huán)太平洋大學聯(lián)盟、21世紀學術(shù)聯(lián)盟、全球大學高研院聯(lián)盟、國際應(yīng)用科技開發(fā)協(xié)作網(wǎng)、東亞研究型大學協(xié)會、新工科教育國際聯(lián)盟、中國高校行星科學聯(lián)盟、長三角研究型大學聯(lián)盟、學位授權(quán)自主審核單位成員，首批國家級雙創(chuàng)示范基地。

南京大學肇始于1902年創(chuàng)建的三江師范學堂，此后歷經(jīng)兩江師范學堂、南京高等師范學校、國立東南大學、國立中央大學等歷史時期，1950年更名為南京大學。1952年，調(diào)整出部分院系后與創(chuàng)辦于1888年的金陵大學文、理學院等合并，仍名南京大學。校址從四牌樓遷至鼓樓金陵大學原址。2006年，教育部和江蘇省簽訂重點共建南京大學的協(xié)議。2011年，教育部和江蘇省簽署協(xié)議繼續(xù)重點共建南京大學。

東南大學

東南大學（Southeast University），簡稱“東大”，本部位于南京，是教育部直屬的全國重點大學，中央直管副部級建制，是國家“雙一流”、“985工程”、“211工程”建設(shè)高校，入選“強基計劃”、“2011計劃”、“111計劃”、卓越工程師教育培養(yǎng)計劃、卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計劃、高等學?；A(chǔ)研究珠峰計劃、學位授權(quán)自主審核單位、首批未來技術(shù)學院建設(shè)高校，為“建筑老八校”、卓越大學聯(lián)盟、長三角可持續(xù)發(fā)展大學聯(lián)盟、中英大學工程教育與研究聯(lián)盟、中俄工科大學聯(lián)盟、碳中和世界大學聯(lián)盟成員。

學校肇始于1902年創(chuàng)建的三江師范學堂，后歷經(jīng)兩江師范學堂、南京高等師范學校、國立東南大學、國立中央大學等重要發(fā)展時期。1952年全國高校院系調(diào)整，學校文理等科遷出，以原國立中央大學工學院為主體，先后并入復(fù)旦大學、交通大學、浙江大學、金陵大學等校的有關(guān)系科，在國立中央大學本部原址建立南京工學院。1988年5月，學校復(fù)更名為東南大學。2000年4月，原東南大學、南京鐵道醫(yī)學院、南京交通高等?？茖W校合并，南京地質(zhì)學校并入，組建新的東南大學。